燃料电池发动机是将氢气转化成电力的装置，这种反应远不像气体燃烧来得那么剧烈，而是平静地进行着，因为这只是一场电化学反应，这也是氢燃料发动机被叫燃料电池的缘故。由电堆、空气子系统、氢气子系统、水热管理系统、控制系统构成。该模型详细描述了上述子系统的构成和配合关系。