谷物清选机的工作原理是基于谷物与杂质在物理特性（如尺寸、形状、密度、空气动力学特性等）上的差异，通过各种清选方式将杂质从谷物中分离出来。常见的清选方式有风选、筛选、比重选、磁选等，可单独使用或组合使用。